את הגורמים לאפילפסיה ניתן לחלק לשתי קבוצות עיקריות: גורמים גנטיים וגורמים נרכשים. הגורמים לאפילפסיה הם מורכבים ולעיתים קשים לזיהוי. במקרים מסוימים ניתן לזהותם בהתאם לגיל בו החלו ההתקפים.

ניתן לחלק את הגורמים לאפילפסיה לשתי קבוצות:

גורמים גנטיים וגורמים נרכשים, כאשר לעתים קרובות יש אינטראקציה בין גורמים משתי הקבוצות. בקבוצת הגורמים הנרכשים ניתן למנות:

• פגיעות ראש חמורות
• שבץ
• גידולים במוח, שפירים או ממאירים
• זיהומים של המוח שמקורם בנגיפים, בחיידקים או בפטריות
• מומים מולדים, כמו נזק מוחי סביב זמן הלידה
• אלכוהוליזם
• דלקות – מצבים דלקתיים כוללים דלקות אימוניות של המוח (ADEM), מעורבות של המוח במחלות דלקתיות כלליות כגון לופוס, או דלקת בכלי דם (וסקוליטיס) ומצבים אימוניים אחרים ראשוניים, בגלל נוכחות נוגדנים לרקמת המוח.